Cihan harbi sona ermiş, ülke teslim alınmıştır. Yunan işgal kuvvetleri, Yalova köylerine silahlarını teslim etmesi için haber göndermiştir.
Burhaniye Köyü’nden Rasim ve Abdülkadir bunun intihar etmek manasına geldiğini bilmektedir. Zaman onları haklı çıkaracak, silahını teslim eden bölgeler kıyımdan geçirilirken, bu iki kahramanın kararlılığı Burhaniye Müfrezesi’nin kurulmasını sağlayacak ve bu müfreze Kurtuluş Savaşı’nın sonuna kadar ayakta kalacaktır.
Son Müfreze, Kuvayı Milliye hareketinin bilinmeyen bir safhasının romanı. Kurtuluş Savaşı’nın Yalova’daki safahatını anlatan ve gerçek hadiselere dayanan bir direniş ve kahramanlık destanı.