Dr. Mustafa Akdoğan, S.Ü. Tıp Fakültesini bitirdi.
Mzuniyetten sonra 30 sene çeşitli kamu kuruluşlarında ve özel sağlık kuruluşlarında hekimlik yaptıktan sonra kendi isteği ile emekliye ayrıldı. Gerek üniversite hayatı esnasında, gerekse daha sonraki dönemlerde, Arapça, Tefsir, Siyer, Hadis ve Fıkıh alanlarında çalışmalar yaptı. Özellikle Kütüb-ü Sitte ve “El Müsned başta olmak üzere hadis kitapları, Tabakât ve Siyer kitapları üzerinde araştırmalar ve tercümeler yaptı. Geçmişte ve günümüzde İslâm Toplumlarındaki ihtilâflar ve bunların temel sebepleri üzerinde tamamlanmış ve basıma hazırlanması devam eden birçok eseri bulunmaktadır.
Yapılan bu araştırmaların bütünü, İslam tarihi boyunca ulemâ tarafından geçerli sayılan kaynaklardan iktibâs edilmiş, ön yargıdan kurtulup müstakil düşünen ve muhâkeme eden özgür insanların istifâdesine sunulmuştur.