Felsefe Dersleri’nin ikinci cildinde, Üstad Mutahharî’nin Kum’da Esfâr dersinde irad ettiği ve vazifeden ayrıldıktan sonra da bizâtihi kendisinin tashih edip tamamladığı *Hareket* konusunda bir bölüm; yine Mervi Medresesi’nde okutulan İbn Sînâ’nın İlâhiyyât-ı Şifâ’sının *Gâyât* konusundan bir bölüm yer almaktadır.
İbn Sînâ’nın Necât adlı eserinden bazı kısa bölümler ve *Kelam* ilmine ilişkin bahislerden bir kısmı da ikinci cilde dahil edilmiştir.
Yine Şifâ ve İşârât’ı eksene alarak Vâcibu’l-vucûd (zorunlu varlık), zorunlu varlığın özellikleri, ilk ilke oluşu, mümkün varlıkla ilişkisi; mutluluk ve haz, mutluluğun özellikleri ve dereceleri, hayır ve şer problemi; ariflerin makamları, zühd ve takvâ, seyr-ü sülûk, riyazât, nübüvvet; varlık ve çeşitli cevherler, araz taksimi, madde ve sûret ilişkisi, madde ile enerjinin bağlantısı ve nihai olarak da tertîbü’l-vucûd gibi felsefenin temel meselelerinde Üstadın verdiği derslere de kitapta yer verilmiştir