Seyran ve Ali, Silvan`da yaşayan, birbirlerine deli gibi aşık olan iki gençtir. Seyran zengin bir ailenin kızı, Ali ise amcası tarafından büyütülen yetim bir gençtir ve Seyran`ın evinde hizmetçidir.  Seyran`ın ailesi, onu zengin bir aileye vermek ister. Seyran`ın abisi Kasım, kız kardeşinin gönlünün Ali`de olduğunu anlar ve isteği reddeder.  Ali, Seyran`ı istemeye cesaret edemez çünkü yoksuldur. Seyran, Ali`ye kaçmayı teklif eder.

Ayrılık Çeşmesi`nde buluşup Batman`a kaçarlar. Midyat`a doğru giderken, bir şoförün yardımıyla Kafro köyüne ulaşırlar.  İskân Ağa adında zengin ve güçlü bir adamın himayesine sığınırlar. Ancak İskân Ağa, Seyran`ın güzelliğine kapılıp Ali`yi öldürür ve Seyran`ı kaçırmaya çalışır. Seyran, İskân Ağa`dan kurtulup dağlarda kaybolur.

Fıkıh öğrencileri tarafından bulunan Seyran, Ali`nin öldüğünü ve İskân Ağa`nın yaptıklarını anlatan bir not yazar.  Not, Kasım`a ulaşır. Kasım, köylülerle birlikte İskân Ağa`yı bulup öldürür ve Ali`nin cesedini alır. Seyran, Ferit adlı bir fıkıh öğrencisinin ailesi tarafından bulunur ve Kasım tarafından alınır.

Ali ve Seyran`ın cenazeleri, Ayrılık Çeşmesi`ne defnedilir. Seyran, Ali`nin ardından kısa süre sonra ölür ve onun yanına gömülür.  İskân Ağa`nın adı lanetlenir, Ali ve Seyran`ın hikayesi ise bir aşk ve ihanet destanı olarak nesilden nesile aktarılır.